Ezequiel Muñoz del Lanús ha giocato nella maggior parte delle gare della sua squadra in Liga Profesional Argentina nel 2025, avendo collezionato 20 presenze, per un totale di 1379 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 15 presenze su 34 giornate ed è subentrato 5 volte.
Muñoz ha collezionato la sua ultima presenza il 3 novembre, con il Lanús: una sconfitta per 2-1 contro il Banfield, in cui ha giocato 90 minuti. In totale il difensore ha fornito 1 assist in questo campionato.
Nella passata stagione di Liga Profesional Argentina Muñoz è sceso in campo in 29 partite con il Lanús, gare in cui ha segnato 2 gol e fornito 1 assist vincente.
Il difensore è tornato a giocare con il Lanús nel gennaio 2024 dopo un'esperienza in prestito con l'Estudiantes, con cui ha collezionato 19 presenze in campionato.