L'attaccante Melbourne Victory Francesco Margiotta è sceso in campo nella maggior parte delle partite della sua squadra in A-League Men nel 2021/2022, avendo collezionato 25 presenze, per un totale di 1059 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 12 di queste presenze, su 28 giornate, ed è stato utilizzato da subentrato in 13 occasioni.
Margiotta ha giocato la sua ultima gara il 21 maggio, con Melbourne Victory: una sconfitta per 4-1 contro Western United, in cui ha giocato solamente 6 minuti. L'attaccante ha realizzato 4 gol in questo campionato.
L'ultimo gol di Margiotta in campionato è arrivato nella vittoria per 2-1 contro Newcastle Jets, il 16 aprile. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro Adelaide United l'11 dicembre, con una rete nella vittoria per 2-1.
Margiotta ha giocato 31 partite di Serie B nell'ultima stagione con Chievo, realizzando 5 gol e fornendo 4 passaggi vincenti.
Prima di cominciare l'esperienza con Melbourne Victory nell'ottobre 2021, Margiotta ha collezionato 31 presenze in campionato con Chievo, per un totale di 5 gol e 4 assist.