Francisco Báez è un difensore Envigado che ha giocato nella maggior parte delle gare del club in Primera A nel 2021, avendo collezionato 9 presenze, per un totale di 711 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 9 presenze, su 18 giornate.
La sua ultima presenza nella competizione risale al 23 marzo, gara in cui ha giocato 72 minuti con la maglia Envigado contro Boyacá Chicó, nella sconfitta per 3-0.
Nell'ultima stagione con Envigado in Primera A Báez ha collezionato 22 presenze, realizzando 1 gol e fornendo 1 passaggio vincente.
Il difensore ha iniziato la sua esperienza con Envigado nel gennaio 2019, mentre prima giocava con Deportivo Santaní, con cui ha collezionato 31 presenze in campionato.