Omar Mendoza è un difensore del Querétaro che è sceso in campo nella maggior parte delle partite della sua squadra in Liga MX nel 2023/2024, avendo collezionato 26 presenze, per un totale di 2078 minuti. É partito titolare in 26 presenze, su 35 giornate.
La sua ultima presenza in Liga MX risale al 3 maggio, partita in cui ha giocato 90 minuti con la maglia del Querétaro contro il Club Necaxa, nella sconfitta per 4-3. In questa stagione il difensore ha registrato 1 assist. Ha ricevuto 5 cartellini gialli, oltre a essere stato espulso 2 volte.
Nell'ultima stagione con il Querétaro FC in Liga MX Mendoza ha collezionato 28 presenze, gare in cui ha fornito 2 passaggi vincenti.
Prima di cominciare l'esperienza con il Querétaro FC nel gennaio 2021, Mendoza ha collezionato 63 presenze in campionato con il Tijuana, per un totale di 1 assist.