Emil Holm dell'Atalanta è sceso in campo nella maggior parte delle gare della sua squadra in Serie A nel 2023/2024, avendo collezionato 20 presenze, per un totale di 827 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 10 presenze su 35 giornate ed è stato utilizzato come subentrato in 10 occasioni.
Holm ha giocato la sua ultima partita il 21 aprile, con l'Atalanta: una vittoria per 2-1 contro il Monza, in cui ha giocato 28 minuti. In totale il difensore ha segnato 1 gol in questa stagione; ha inoltre offerto 1 assist. Ha ricevuto 5 cartellini gialli.
Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro il Frosinone il 15 gennaio, avendo segnato nella vittoria per 5-0.
L'Atalanta è attualmente al 5° posto in classifica, con 63 punti, e nella prossima partita di Serie A, il 18 maggio, dovrà giocare una trasferta contro il Lecce.
Nella passata stagione di Serie A Holm è sceso in campo in 20 partite con lo Spezia, gare in cui ha segnato 1 gol e fornito 1 passaggio vincente.
Il difensore è passato a giocare in prestito con l'Atalanta nell'agosto 2023. In precedenza giocava per lo Spezia, per cui ha collezionato 20 presenze in campionato, con 1 gol e 1 assist, dopo aver raggiunto il club nel luglio 2022, mentre prima giocava per il SønderjyskE.
Il 14 agosto 2022 Holm ha debuttato in Serie A con lo Spezia, a 22 anni e 93 giorni, contro l'Empoli. La prima presenza con la sua attuale squadra, l'Atalanta, in Serie A è stata nella gara contro il Monza il 2 settembre 2023.
In totale, nella sua carriera in Serie A, ha collezionato 40 presenze con 2 gol e 2 assist per i compagni.