Viktor Kovalenko del Empoli ha collezionato 17 presenze, per un totale di 605 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 4 partite su 35 giornate ed è stato frequentemente utilizzato come subentrato, in 13 occasioni.
Kovalenko ha collezionato la sua ultima presenza il 28 aprile, con l'Empoli: una sconfitta per 2-0 contro l'Atalanta, in cui ha giocato 28 minuti. In totale il centrocampista ha realizzato 1 rete in questa stagione; ha inoltre offerto 1 assist.
Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro il Napoli il 12 novembre, avendo segnato nella vittoria per 1-0.
L'Empoli si trova al 17° posto nella classifica stagionale, con 32 punti, e nella prossima partita di Serie A, il 12 maggio, dovrà giocare una trasferta contro la Lazio.
Nella passata stagione di Serie A Kovalenko è sceso in campo in 19 partite con lo Spezia.
Kovalenko è passato a giocare in prestito con l'Empoli nell'agosto 2023. In precedenza giocava per l'Atalanta, per cui ha collezionato 1 presenzan in campionato, dopo aver raggiunto il club nel febbraio 2021, mentre prima giocava per Shakhtar Donetsk.
Il 21 marzo 2021 Kovalenko ha esordito in Serie A con l'Atalanta, all'età di 25 anni e 35 giorni, contro l'Hellas Verona. La prima presenza con il suo club attuale, l'Empoli, in Serie A è stata nella partita contro la Juventus il 3 settembre 2023.
In generale, in Serie A, ha giocato 63 partite con 2 gol e 5 assist per i compagni.