Guillermo Fernández del Godoy Cruz è sceso in campo in 13 partite di Liga Profesional Argentina nel 2025 dopo aver raggiunto il club il 27 giugno 2025, essendo partito titolare in 8 di queste ed essendo stato utilizzato a partita in corso 5 volte.
Il centrocampista ha giocato la sua ultima partita il 9 novembre, con il Godoy Cruz: una sconfitta per 2-1 contro l'Atlético Tucumán, in cui ha giocato 77 minuti. Ha ricevuto 6 cartellini gialli.
Nell'ultima stagione con il Boca Juniors in Liga Profesional Argentina Fernández ha collezionato 33 presenze.
Prima di cominciare l'esperienza con il Godoy Cruz nel giugno 2025, il centrocampista ha collezionato 19 presenze in campionato con il Fortaleza, per un totale di 2 assist.