Jonathan dos Santos del América è sceso in campo nella maggior parte delle gare della sua squadra in Liga MX nel 2023/2024, avendo collezionato 37 presenze, per un totale di 2830 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 32 di queste presenze, su 40 giornate, ed è entrato a gara in corso 5 volte.
La sua ultima presenza nella competizione risale al 21 aprile, partita in cui ha giocato 90 minuti con la maglia del América contro il Pumas UNAM, nella sconfitta per 2-1. In totale il centrocampista ha fornito 1 assist in questo campionato. Ha ricevuto 7 cartellini gialli.
Dos Santos ha giocato 26 partite di Liga MX nell'ultima stagione con il Club América, gare in cui ha segnato 1 gol.
Prima di arrivare a vestire la maglia del América nel gennaio 2022, il centrocampista ha collezionato 105 presenze in campionato con i L.A. Galaxy, per un totale di 7 reti e 7 assist.