Ezequiel Bonifacio è un difensore del Independiente Rivadavia che è sceso in campo 11 volte in Liga Profesional Argentina in questa stagione, con tutte queste che sono state per la sua attuale squadra. Ha giocato anche per il Banfield durante la stagione 2025.
L'ultima presenza di Bonifacio in Liga Profesional Argentina risale al 17 novembre, partita in cui ha giocato 16 minuti con la maglia del Independiente Rivadavia contro il Defensa y Justicia, nella vittoria per 2-0.
Bonifacio ha giocato 21 partite di Liga Profesional Argentina nell'ultima stagione con il Banfield, fornendo 1 passaggio vincente.
Bonifacio ha iniziato la sua esperienza con Independiente Rivadavia nel maggio 2025, mentre prima giocava con il Banfield, con cui ha collezionato 44 presenze in campionato, con 2 assist forniti.