Fernando Beltrán del León è sceso in campo nella maggior parte delle gare del suo club in Liga MX nel 2025/2026, avendo collezionato 31 presenze, per un totale di 2030 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 25 di queste presenze, su 34 giornate, ed è entrato a gara in corso 6 volte.
Il centrocampista ha collezionato la sua ultima presenza il 25 aprile, con il León: una sconfitta per 4-1 contro il Deportivo Toluca, in cui ha giocato 56 minuti. In totale il centrocampista ha realizzato 3 reti in questa stagione; ha inoltre registrato 2 assist. Ha ricevuto 5 cartellini gialli.
É stato contro il Club América il 21 aprile che Beltrán ha segnato il suo ultimo gol, nella sconfitta per 3-2. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro il Querétaro FC il 30 agosto, avendo realizzato una rete nella vittoria per 3-0.
Beltrán ha giocato 31 partite di Liga MX nell'ultima stagione con il Chivas, gare in cui ha realizzato 1 gol e fornito 1 assist vincente.
Prima di cominciare l'esperienza con il León nel luglio 2025, Beltrán ha collezionato 230 presenze in campionato con il Chivas, per un totale di 13 gol e 12 assist.