Giovanni Bonfanti del Pisa ha giocato 9 gare in Serie A in questa stagione, con tutte queste che sono state per la sua squadra attuale. Ha giocato anche per l'Atalanta durante la stagione 2025/2026.
La sua ultima presenza in Serie A risale al 3 gennaio, gara in cui ha giocato 72 minuti con la maglia del Pisa contro il Genoa, nel pareggio per 1-1.
La prossima sfida per il Pisa sarà una sfida casalinga contro Como, il 6 gennaio.
Nella passata stagione di Serie B Bonfanti è sceso in campo in 22 partite con il Pisa, fornendo 1 assist vincente.
Il difensore è passato a giocare in prestito con il Pisa nel settembre 2025. In precedenza giocava per l'Atalanta, per cui ha collezionato 2 presenze in campionato, mentre prima giocava per Atalanta II.
Il 25 novembre 2023 Bonfanti ha fatto il suo esordio in Serie A con l'Atalanta, all'età di 20 anni e 312 giorni, contro il Napoli. La prima presenza con il suo club attuale, il Pisa, in Serie A è stata nella gara contro l'Udinese il 14 settembre 2025.