Javier Boñar dell'Atletico Madrid ha collezionato 4 presenze, per un totale di 299 minuti. È stato scelto nell'11 iniziale in 3 di queste presenze su 38 giornate ed è entrato dalla panchina 1 volta.
L'ultima partita di Boñar in LaLiga è stata il 24 maggio, gara in cui ha giocato 29 minuti con la maglia dell'Atletico Madrid contro il Villarreal, nella sconfitta per 5-1. In totale il difensore ha realizzato 1 gol nel 2025/2026.
Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro il Siviglia l'11 aprile, avendo segnato nella sconfitta per 2-1.
Nell'ultima stagione con Atlético Madrileño in Primera División RFEF Boñar ha collezionato 33 presenze, gare in cui ha realizzato 4 gol.
A 20 anni e 312 giorni, Boñar ha iniziato al meglio la sua carriera in LaLiga, l'11 aprile 2026, con l'Atletico Madrid. Il difensore ha segnato un gol nella sua prima partita nella competizione, contro il Siviglia. In totale, nella sua carriera in LaLiga, ha giocato 4 partite, con 1 gol segnato, senza un assist.