Sebastián Prieto del Argentinos Juniors è sceso in campo nella maggior parte delle partite del suo club in Liga Profesional Argentina nel 2025, avendo collezionato 32 presenze, per un totale di 2427 minuti. É partito titolare in 28 di queste presenze, su 36 giornate, ed è entrato a gara in corso 4 volte.
La sua ultima partita in campionato è stata il 30 novembre, partita in cui ha giocato 77 minuti con la maglia del Argentinos Juniors contro il Boca Juniors, nella sconfitta per 1-0. In totale il difensore ha realizzato 2 gol nel 2025; ha inoltre registrato 2 assist. Ha ricevuto 6 cartellini gialli.
L'ultimo gol di Prieto in campionato è stato nella sconfitta per 2-1 contro Tigre, il 20 luglio. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro il Racing Club il 15 febbraio, con una rete nella vittoria per 3-2.
Prieto ha giocato 18 partite di Liga Profesional Argentina nell'ultima stagione con l'Argentinos Juniors, gare in cui ha fornito 2 assist.
Prima di arrivare a vestire la maglia del Argentinos Juniors nel gennaio 2024, Prieto ha collezionato 110 presenze in campionato con Tigre, per un totale di 4 reti e 5 assist.