Federico Pereira è un difensore del Toluca che è sceso in campo nella maggior parte delle partite del suo club in Liga MX nel 2025/2026, avendo collezionato 34 presenze, per un totale di 2798 minuti. É partito titolare in 31 di queste presenze, su 42 giornate, ed è entrato a gara in corso 3 volte.
La sua ultima presenza in campionato risale al 4 aprile, partita in cui ha giocato 90 minuti con la maglia del Toluca contro il Querétaro FC, nella sconfitta per 1-0. In totale il difensore ha segnato 3 reti nel 2025/2026. Ha ricevuto 9 cartellini gialli.
É stato contro il Club Necaxa il 21 febbraio che Pereira ha segnato il suo ultimo gol, nella vittoria per 3-0. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro il Club Puebla il 13 settembre, avendo realizzato una rete nella vittoria per 3-1.
Nella passata stagione di Liga MX Pereira ha giocato 32 partite con il Deportivo Toluca, gare in cui ha segnato 1 gol.
Il difensore è tornato a giocare con il Deportivo Toluca nel luglio 2025 dopo un'esperienza in prestito con Liverpool, con cui ha collezionato 101 presenze in campionato, con 10 gol segnati.