Filip Bilbija del Paderborn ha giocato in ogni gara di 2. Bundesliga del 2025/2026, sempre da titolare.
La sua ultima partita nella competizione risale al 28 novembre, partita in cui ha giocato 62 minuti con la maglia del Paderborn contro lo Schalke 04, nella sconfitta per 2-1. Il centrocampista è attualmente al 3° posto, a pari merito, nella classifica cannonieri di 2. Bundesliga con 8 gol in questa stagione, ed è il migliore marcatore della sua squadra. Bilbija inoltre ha fornito 1 assist.
É stato contro il Greuther Fürth il 2 novembre che Bilbija ha segnato il suo ultimo gol, nella vittoria per 2-1. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro l'Holstein Kiel il 2 agosto, avendo realizzato una rete nella vittoria per 2-1.
La gara casalinga contro Elversberg, il 6 dicembre, sarà la prossima gara di 2. Bundesliga per il Paderborn.
Bilbija ha giocato 33 partite di 2. Bundesliga nell'ultima stagione con il Paderborn, realizzando 9 gol e fornendo 7 assist.
Prima di arrivare a vestire la maglia del Paderborn nel luglio 2023, il centrocampista ha collezionato 1 presenzan in campionato con Hamburger SV II, per un totale di 1 gol.
Il 24 luglio 2021 Bilbija ha debuttato in 2. Bundesliga con Ingolstadt, a 21 anni e 91 giorni, contro Dynamo Dresden. La prima presenza con la sua attuale squadra, il Paderborn, in 2. Bundesliga è stata nella sfida contro il Greuther Fürth il 30 luglio 2023.
In totale, nella sua carriera in 2. Bundesliga, ha collezionato 115 presenze con 30 gol e 14 assist per i compagni.