Il difensore del Tijuana Rafael Fernández è sceso in campo nella maggior parte delle gare della sua squadra in Liga MX nel 2025/2026, avendo collezionato 17 presenze, per un totale di 1486 minuti. É partito titolare in tutte le 17 presenze, su 20 giornate.
L'ultima presenza di Fernández nella competizione è stata il 29 novembre, partita in cui ha giocato 90 minuti con la maglia del Tijuana contro il Tigres UANL, nella sconfitta per 5-0. In totale il difensore ha realizzato 1 gol in questa stagione; ha inoltre fornito 2 assist.
Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro il León il 19 settembre, avendo segnato nella vittoria per 5-0.
Fernández ha giocato 29 partite di Liga MX nell'ultima stagione con il Tijuana.
Il difensore è passato a giocare con il Tijuana nel giugno 2023, mentre prima giocava con il Querétaro FC, con cui ha collezionato 18 presenze in campionato, con 1 gol segnato.