Markus Schubert è un portiere del Paderborn che non ha disputato nessuna delle 17 partite che il suo club ha disputato finora in 2. Bundesliga nel 2025/2026.
La sua ultima partita in campionato è stata il 22 febbraio 2025, gara in cui ha giocato 90 minuti con la maglia del Paderborn contro l'Hannover, nel pareggio per 1-1.
La trasferta contro l'Holstein Kiel, il 18 gennaio, sarà la prossima sfida di 2. Bundesliga per il Paderborn.
Nella passata stagione di 2. Bundesliga Schubert ha giocato 12 partite con il Paderborn, gare in cui ha mantenuto 3 volte la porta inviolata.
Prima di cominciare l'esperienza con il Paderborn nel luglio 2024, il portiere ha collezionato 21 presenze in campionato con il Vitesse.
Ha debuttato in 2. Bundesliga con il suo club attuale, il Paderborn, nella gara con il Colonia il 25 ottobre 2024, ma il suo esordio in generale nella competizione è stato il 25 gennaio 2018 giocando con Dynamo Dresden nella gara contro il St. Pauli, all'età di 19 anni e 227 giorni. In generale, in 2. Bundesliga, il portiere ha disputato 52 partite, avendo ottenuto finora 14 clean sheet.