Ruben Müller del Paderborn ha collezionato 5 presenze, per un totale di 163 minuti. É partito titolare in 2 partite su 14 giornate ed è stato soprattutto utilizzato come subentrato, in 3 occasioni.
L'ultima partita di Müller nella competizione è stata il 2 novembre, partita in cui ha giocato 13 minuti con la maglia del Paderborn contro il Greuther Fürth, nella vittoria per 2-1. In totale il centrocampista ha offerto 1 assist in questa stagione.
Nella prossima partita di 2. Bundesliga, il 6 dicembre, il Paderborn dovrà giocare una gara casalinga contro Elversberg.
Nella passata stagione di Regionalliga Müller ha giocato 32 partite con Freiburg II, realizzando 3 gol.
Prima di arrivare a vestire la maglia del Paderborn nel luglio 2025, il centrocampista ha collezionato 32 presenze in campionato con Freiburg II, per un totale di 3 gol.
Il 12 settembre 2025 Müller ha debuttato in 2. Bundesliga, a 20 anni e 19 giorni contro il Bochum. In generale in 2. Bundesliga, ha giocato 5 partite, con 1 assist.